Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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