Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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