Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFEMP1Q12805 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms