Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms