Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCC8Q09428 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC8Q09428 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms