Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TFF3Q07654 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms