Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms