Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
EMX2Q04743 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EMX2Q04743 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms