Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OC90Q02509 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms