Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSC2Q02487 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms