Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms