Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms