Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms