Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms