Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms