Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms