Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms