Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKD1P98161 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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PKD1P98161 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKD1P98161 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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