Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB1AP62820 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB1AP62820 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB1AP62820 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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