Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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