Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA9P57773 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms