Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms