Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN8P56748 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN8P56748 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms