Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms