Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD4P55036 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD4P55036 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms