Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms