Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCR5P51681 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCR5P51681 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR5P51681 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms