Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA2P51531 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms