Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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