Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT3P45378 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms