Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIA3P42263 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms