Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR1BP42025 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms