Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms