Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPIFP30405 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PPIFP30405 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms