Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB9P28065 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms