Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms