Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
APCP25054 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
APCP25054 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
APCP25054 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
APCP25054 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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