Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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