Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCNA2P20248 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms