Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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