Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-EP13747 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms