Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC4P09017 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC4P09017 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms