Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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PKHD1P08F94 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
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PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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PKHD1P08F94 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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PKHD1P08F94 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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PKHD1P08F94 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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