Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms