Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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UBXN7O94888 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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UBXN7O94888 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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