Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms