Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRODHO43272 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRODHO43272 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRODHO43272 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRODHO43272 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms