Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
FANCAO15360 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
FANCAO15360 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCAO15360 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCAO15360 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms