Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF197O14709 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms