Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms